保函与跟单信用证相比，当事人的权利和义务基本相同，所不同的是跟单信用证要求受益人提交的单据是包括运输单据在内的商业单据，而保函要求的单据实际上是受益人出具的关于委托人违约的声明或证明。这一区别，使两者适用范围有了很大的不同，保函可适用于各种经济交易中，为契约的一方向另一方提供担保。另外，如果委托人没有违约，保函的担保人就不必为承担赔偿责任而付款。而信用证的开证行则必须先行付款。
付款保函 付款保函是指，应买方或发包方的要求，银行向卖方或承包方出具的、保证买方履行商品、技术、专利或劳务合同项下的付款义务、或发包方按照承包工程进度支付工程款项的书面承诺。根据被担保的付款方式不同，可分为即期付款保函、延期付款保函、分期付款保函。
履约保函 是银行(担保人)应交易合同中的一方当事人(申请人)的请求，开立的以另一方当事人为受益人的保函，承诺在申请人未能履行合同规定的义务时，银行将支付给受益人一定金额作为赔偿。
投标保函 主要用于国际投标与招标业务，通常是招标人要求投标人参加投标的条件之一。银行(担保人)应投标人(申请人)的申请，开立的以招标人为受益人的保函，保证投标人在开标之前不中途撤销投标、不片面修改投标条件或中标后不拒绝签约、不拒绝交纳履行保证金或提供银行的履约保函，否则银行将支付给招标人一定的金额作为赔偿。其目的在于表明投标人的诚意与资格。