雨花石的成分是以二氧化硅为主，其中红色成分为铁离子和亚铁离子。雨花石是石质为玛瑙、蛋白石、玉髓、石英等的卵石，见于河床、河流阶地的沉积物之中。
雨花石又分为细石和粗石两类，细石以玛瑙为主，石质细腻，颜色艳丽，磨圆度高，晶莹可爱；粗石质地较粗，以石英或变质岩为主，价值较低。美丽的雨花石中常可呈现各种山水、人物、鸟兽、树木等景象，使人遐想联翩，思绪入石，非常漂亮。由于雨花石种类繁多，它的成因和化学成分极为复杂。以玛瑙砾石为例，它来源于原生玛瑙。一般认为，原生玛瑙是由岩浆的残余热液形成的。这种热液充填在火山岩如玄武岩、流纹岩的空隙中，因空隙的形状不同，或成玛瑙球，或成玛瑙脉。经过自然力的作用，原生玛瑙脱落而出，再经过山洪冲击，流水搬运，磨成卵石。这就是我们所见到的在砾石层中的雨花玛瑙石。